全臺詩 為臺灣文學史上重要的古典文獻,自2001年至今,從原文化資產保存研究中心籌備處至國立臺灣文學館,「《全臺詩》的蒐集、整理、編輯計畫」,預計完成臺灣文學史中明鄭時期、清領時期、日治時期的臺灣古典詩之蒐集、整理及校勘。施懿琳為這項龐大計畫掌舵。此工程按階段逐漸進行,分批出版。2003年《全臺詩》出版第一批研究成果,共5冊,內容包括明鄭時期到清領咸豐元年以前的詩作,約80萬字,480餘位詩人;2008年出版第二批研究成果,共計7冊,內容包括清領咸豐時期到光緒元年,約120萬字,180餘位詩人。《全臺詩》計畫目前仍持續進行下一階段的編纂整理工作。